Здравствуйте, Анна!

В приведённом примере слово «или» — лишнее. Фраза должна выглядеть следующим образом:

А ТАКЖЕ не менее двух симптомов из следующих:
a) сыпь, двусторонний негнойный конъюнктивит либо признаки воспалительного поражения кожи и слизистых оболочек (полость рта, кисти рук, стопы);

Перед нами три однородных члена, из которых между первыми двумя стоит запятая, а третий присоединён союзом «либо». Запятая перед ним не нужна.